鸿蒙之中，天地未开，一片混沌，看起来就好像一只鸡蛋，用了无尽的时间在其中孕育了三千魔神。其中最强大的也是唯一的人形就是他们的首领，他就是盘古，号称元始天王。盘古在混沌之中，觉得胸口憋闷，挥起神斧奋力一劈，天地初开。盘古开天辟地之后，历经开天之劫的三千魔神几乎死伤殆尽。幸有盘古躯体化作万物，天地才有复苏的机会。

盘古陨落之后，他的左眼化作了太阳星，其上孕育了三足金乌一脉帝俊、太一两兄弟，他的右眼化作了太阴星，其上孕育了玉兔一脉羲和、嫦曦两姐妹。北冥之地孕育出鲲鹏，混沌之中生出伏羲、女娲人首蛇身两兄妹。

后有帝俊、太一立天庭称天帝，统领上古妖族，迎娶羲和、嫦曦二姐妹为天后，封鲲鹏为妖师。伏羲、女娲二人皆有大神通，不在天庭管理之内。

又有由盘古十二道浊气化成的十二祖巫带领的巫族，因为妖族帝俊、太一称天帝而不满，多次发生大战。此时，以身合道的鸿钧现身，制止了一触即发的大战，定下千年之约，发布“妖族掌天，巫族掌地”的命令。

千年中，十二祖巫之一后土，感念天下苍生死后灵魂无归，身化六道轮回弥补天地缺憾。巫族掌管六道轮回，立有地规，六道轮回中的盘古精血随人类、妖族的轮回，附着于魂魄之上，再生出来，便有天生神通，是为大巫。

后帝俊与羲和的十个儿子调皮出门玩耍，因为修为不精不能很好的收敛自身的太阳真火，导致他们飞过的地方大地顿时一片哀嚎，寸草不生，生灵涂炭。大地之主巫族因为十只金乌的无心之失，损失惨重，于是大巫夸父怒而追日，最后力竭而死。夸父好友后羿为其报仇，将十只金乌射死九只，至于最小的一只名为陆压在众位哥哥的掩护下逃过一劫。

自此，巫族因为大巫夸父的死亡，举族震怒，妖族更是十个太子去其九，愤愤不平。巫妖之战彻底爆发，以此拉开序幕。

在巫妖大战最后，众祖巫与帝俊、太一同归于尽，水之祖巫共工一头撞上了不周山。不周山一倒，天柱断裂，天上出现了一个大窟窿，天河之水源源不断的落入人间。大水使得所剩不多的巫妖二族再次受到重创，幸而得圣人出手相助，才保得最后一丝血脉。巫妖二族在大战中损失惨重，彻底退出历史的舞台，人族成为开启新篇章的主角。